Общество: Ученые создали инструмент для быстрой «сборки» генома вируса - Cursorinfo: главные новости Израиля
cursorinfo.co.il:

Биоинформатики Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ и Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали ассемблер metaviralSPAdes, который позволяет найти и собрать геном вируса среди множества других последовательностей.

Об этом сообщает пресс-служба российского вуза в понедельник. Новая разработка поможет быстрее и удобнее расшифровывать геномы патогенов, а значит — даст возможность быстрее приступить к разработкам тест-систем и вакцин от опасных инфекций.

Научная статья с результатами работы опубликована в журнале Bioinformatics. Ученые отмечают, что с появлением нового вируса биологи в первую очередь берутся за расшифровку его генома, но секвенирование генома нового патогена во время его вспышки осложняется наличием в отобранном биоматериале геномов многих вирусов и бактерий.

Поэтому исследователям приходится собирать геном вируса, как пазл из миллиона фрагментов. Для сборки последовательности генома сегодня активно применяется созданный восемь лет назад российско-американской командой ученых сборщик SPAdes.

Нажмите, чтобы поделиться новостью
Читать дальше